Startsida
Hjälp
Sök i LIBRIS databas

     

 

Sökning: onr:2j3rvn2l0tffnn4d > Analyzing DNA-immun...

  • Lentini, Antonio,1990- (författare)

Analyzing DNA-immunoprecipitation sequencing data / Antonio Lentini & Colm E. Nestor.

  • E-artikel/E-kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Publicerad:2021
  • texttxtrdacontent
  • computercrdamedia
  • online resourcecrrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:2j3rvn2l0tffnn4d

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Anmärkningar

  • Genome-wide profiling of DNA modifications has advanced our understanding of epigenetics in mammalian biology. Whereas several different methods for profiling DNA modifications have been developed over the last decade, DNA-immunoprecipitation coupled with high-throughput sequencing (DIP-seq) has proven a particularly adaptable and cost-effective approach. DIP-seq was especially valuable in initial studies of the more recently discovered DNA modifications, 5-hydroxymethylcytosine, 5-formylcytosine, and 5-carboxylcytosine. As an enrichment-based profiling method, analysis of DIP-seq data poses several unique, and often unappreciated bioinformatics challenges, which if unmet, can profoundly affect the results and conclusions drawn from the data. Here, we outline key considerations in both the design of DIP-seq assays and analysis of DIP-seq data to ensure the accuracy and reproducibility of DIP-seq based studies.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • Epigenetics
  • DNA methylation
  • Bioinformatics
  • Immunoprecipitation
  • Next-generation sequencing
  • Sequence alignment
  • Antibody
  • IgG
  • DNA modification
  • Peak calling

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Nestor, Colm,1977- (författare)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:DNA ModificationsSidorna 431-439

Länkade data-URI:er (test)

  • https://libris.kb.se/r2qxdq1lpmc45n34#it (Lentini, Antonio, 1990- aut)
  • https://libris.kb.se/2j3rv4bk0rqdk009#it (Nestor, Colm, 1977- aut)
Inställningar Hjälp

Ingår i annan publikation. Gå till titeln DNA Modifications

Sök utanför LIBRIS

Hjälp
Om LIBRIS
Sekretess
Hjälp
Fel i posten?
Kontakt
Teknik och format
Sök utifrån
Sökrutor
Plug-ins
Bookmarklet
Anpassa
Textstorlek
Kontrast
Vyer
LIBRIS söktjänster
SwePub
Uppsök

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy