Startsida
Hjälp
Sök i LIBRIS databas

     

 

Sökning: onr:22430044 > Cyclotide Evolution

Cyclotide Evolution [Elektronisk resurs] Insights from the Analyses of Their Precursor Sequences, Structures and Distribution in Violets (<em>Viola</em>)

Park, Sungkyu (författare)
Yoo, Ki-Oug (författare)
Marcussen, Thomas (författare)
Backlund, Anders 1965- (författare)
Jacobsson, Erik (författare)
Rosengren, K. Johan (författare)
Doo, Inseok (författare)
Göransson, Ulf 1970- (författare)
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
2017
Engelska.
Ingår i: Frontiers in Plant Science. - 1664-462X. ; 8
Läs hela texten
Läs hela texten
Läs hela texten
  • E-artikel/E-kapitel
Sammanfattning Ämnesord
Stäng  
  • Cyclotides are a family of plant proteins that are characterized by a cyclic backbone and a knotted disulfide topology. Their cyclic cystine knot (CCK) motif makes them exceptionally resistant to thermal, chemical, and enzymatic degradation. By disrupting cell membranes, the cyclotides function as host defense peptides by exhibiting insecticidal, anthelmintic, antifouling, and molluscicidal activities. In this work, we provide the first insight into the evolution of this family of plant proteins by studying the Violaceae, in particular species of the genus Viola . We discovered 157 novel precursor sequences by the transcriptomic analysis of six Viola species: V. albida var. takahashii, V. mandshurica, V. orientalis, V. verecunda, V. acuminata , and V. canadensis . By combining these precursor sequences with the phylogenetic classification of Viola , we infer the distribution of cyclotides across 63% of the species in the genus (i.e., ~380 species). Using full precursor sequences from transcriptomes, we show an evolutionary link to the structural diversity of the cyclotides, and further classify the cyclotides by sequence signatures from the non-cyclotide domain. Also, transcriptomes were compared to cyclotide expression on a peptide level determined using liquid chromatography-mass spectrometry. Furthermore, the novel cyclotides discovered were associated with the emergence of new biological functions. 

Ämnesord

Agricultural and Veterinary sciences  (hsv)
Agricultural Biotechnology  (hsv)
Plant Biotechnology  (hsv)
Lantbruksvetenskap och veterinärmedicin  (hsv)
Bioteknologi med applikationer på växter och djur  (hsv)
Växtbioteknologi  (hsv)

Indexterm och SAB-rubrik

cyclotide evolution
viola phylogeny
sequence signature
cyclotide precursor
neofunctionality
novel cyclotide
precursor domain
Inställningar Hjälp

Beståndsinformation saknas

Om LIBRIS
Sekretess
Blogg
Hjälp
Fel i posten?
Kontakt
Teknik och format
Sök utifrån
Sökrutor
Plug-ins
Bookmarklet
Anpassa
Textstorlek
Kontrast
Vyer
LIBRIS söktjänster
SwePub
Sondera
Uppsök

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy